★第三十六話 リン·ミンメイ/林明美（超級(jí)系）
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一條輝追著敵人進(jìn)入MACROSS內(nèi)，然后獲得卡多魯?shù)膸椭］x的主要目的就是在3回合內(nèi)趕到林明美所處之地，然后因?yàn)镸ACROSS的變形一同被卷入地下。接著是味方大量機(jī)體登場(chǎng)與敵增援部隊(duì)周旋。
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★第三十六話 ミス·マクロス/MACROSS小姐（真實(shí)系）
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這一話的版圖是和超級(jí)系一樣的，但是比較短。林明美正在參加MACROSS小姐競(jìng)選時(shí)，天頂星人突然來襲，一條輝就獨(dú)自一人與之對(duì)抗。在第二回合時(shí)死神高達(dá)和沙漠高達(dá)都會(huì)前來援助，等戰(zhàn)斗結(jié)束后他們就能成為仲間。
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★第三十七話 ジュピトリァン/朱比利特（超級(jí)系）
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★第三十七話 木星からの逃亡者/從木星來的逃亡者（真實(shí)系）
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這次的敵人乃是以V GUNDAM為主，其中卡狄吉娜是會(huì)沖向胡素并發(fā)動(dòng)攻擊的，此時(shí)如果選擇“カテジナを擊たない”可加一點(diǎn)熟練度。另外，讓正樹前去說得琉妮亦能提升熟練度。真實(shí)系的情況下，若將敵軍的初期配置消滅后，帝國軍的蕾比便會(huì)出場(chǎng)，最好在她氣力值可達(dá)使用“最終地獄”之前收拾她。
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★第三十八話 帝國の女王（超級(jí)系）
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MACROSS到達(dá)木星圈后，古洛巴爾前去參見？？？帝國的女王，結(jié)果反被關(guān)押起來。布拉度就組織了一個(gè)營救小隊(duì)，要在15回合內(nèi)找到古洛巴爾被關(guān)押的地方。如果上一話有說得琉妮的話，她就會(huì)告之正確位置（地圖最右方），并在正樹的勸說下，琉妮加入隊(duì)伍。能夠成為伙伴的還有兩人，那就是在第四回合內(nèi)以NPC登場(chǎng)的希羅和特洛瓦，只要讓卡多魯與迪奧去說得即可。因?yàn)闀r(shí)間緊迫，所以大家要善用地圖炮來節(jié)約時(shí)間。當(dāng)行至右方時(shí)，蕾比就會(huì)出現(xiàn)，讓隆圣去擋她兩次攻擊后，她就會(huì)再度頭痛并要眾人救她，但緊接著她又恢復(fù)“正?！?，迅速離去。
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★第三十八話 人類を?qū)Г?引導(dǎo)人類的人（真實(shí)系）
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MACROSS抵達(dá)木星圈后，與帝國女王的談判破裂，而且還遭到了？？？軍的襲擊，并被他們潛入MACROSS內(nèi)，其實(shí)敵人的目的乃是女王的女兒夏克蒂。這一關(guān)最重要的就是阻止敵人由地圖上方脫出。因?yàn)閯傞_始只有WING GUNDAM和重裝高達(dá)兩臺(tái)機(jī)體可供使用，所以比較吃力。我方援軍是在第三回合登場(chǎng)，不過此時(shí)的敵人應(yīng)該已離脫出口不遠(yuǎn)了，因此最好使用“加速”快速追擊。戰(zhàn)斗結(jié)束后，WING GUNDAM與重裝高達(dá)正式加入隊(duì)伍。
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★第三十九話 終末への前奏曲/往終末的前奏曲（超級(jí)系）
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★第三十九話 フ?。攻取ぅ偿螗骏?第一次接觸（真實(shí)系）
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好不容易脫離木星，一條輝接到林明美的聯(lián)系，與她一同駕駛著練習(xí)機(jī)外出游玩，結(jié)果撞見了宇宙怪獸（真實(shí)系的話變?yōu)樘祉斝侨耍．?dāng)然憑一條輝那架練習(xí)機(jī)是毫無作為的，所幸EXCELION出現(xiàn)在此宙域（真實(shí)系的話，輝會(huì)被四架敵機(jī)包圍，但因?yàn)閿橙瞬⒉粫?huì)做出主動(dòng)攻擊，所以還是不要無謂地掙扎），且第三回合時(shí)主角和骷髏中隊(duì)趕過來，緩解了危機(jī)。超級(jí)系的話，味方在第七回合時(shí)還會(huì)有增援。此時(shí)，天頂星人突然將輝抓了去，于是主角、骷髏中隊(duì)以及末沙他們也急忙追了過去。
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★第四十話 ビッグ·エスケ－プ/大逃亡（共通）
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眾人被關(guān)在天頂星人的母艦內(nèi)，對(duì)方對(duì)于地球人男女共處而備感驚訝，于是《超時(shí)空要塞》的經(jīng)典場(chǎng)面再現(xiàn)，以接吻來嚇退天頂星人（此時(shí)選擇“カイフンがキスをする”會(huì)提升熟練度，而且一條輝也不會(huì)被帶走），不過也因此明美和凱風(fēng)被帶至別處。接著，眾人伺機(jī)逃脫，要在六回合內(nèi)到達(dá)走出母艦。因?yàn)榛睾舷拗频谋容^嚴(yán)格，所以還是不要貪圖經(jīng)驗(yàn)值，直接往地圖下方?jīng)_。在第二回合時(shí)敵方增援會(huì)登場(chǎng)，那是女天頂星人軍，她們會(huì)和男天頂星人軍交戰(zhàn)。而且按照原作的情節(jié)，讓麥克斯與米莉婭交手的話，會(huì)引發(fā)劇情并提升熟練度。