《地平線 西之絕境》游戲劇情承接前作《地平線 零之曙光》，講述主角女獵人埃洛伊（Aloy）在三十一世紀(jì)的末世后開(kāi)放世界的歷險(xiǎn)故事。本作中埃洛伊?xí)咴L加利福尼亞州、猶他州及內(nèi)華達(dá)州等美國(guó)西部地區(qū)，并會(huì)遇上不同的敵人。

摧毀黑底斯后，埃洛伊離開(kāi)子午城前往各地尋找人工智能“蓋婭”的備份，希望扭轉(zhuǎn)地球生物圈退化所造成的影響。埃洛伊與其友華爾搜索了舊日世界專門從事太空殖民的遠(yuǎn)峰公司設(shè)施，可惜找到的只是伊麗莎白·索貝克博士及其助手為防遠(yuǎn)峰偷竊蓋婭而留下的邏輯炸彈。由于找不到分毫線索，于是華爾建議追蹤賽倫斯?；氐阶游绯?，埃洛伊調(diào)查了該處的尖塔，發(fā)現(xiàn)賽倫斯竟然偷走了黑底斯。賽倫斯聯(lián)系埃洛伊，他表示愿意分享黑底斯隱藏的寶貴知識(shí)，并邀請(qǐng)她在西之絕境碰面?？柤尤司姘Ｂ逡?，指西之絕境由提那科族掌控。

埃洛伊進(jìn)入西之絕境，發(fā)現(xiàn)提那科族正處于內(nèi)戰(zhàn)。提那科族酋長(zhǎng)赫卡羅提倡與卡爾加人和平共存，但叛軍首領(lǐng)雷加拉對(duì)此不滿，執(zhí)意繼續(xù)對(duì)抗卡爾加人。埃洛伊跟隨賽倫斯的蹤跡，前往開(kāi)發(fā)黑底斯的設(shè)施，到達(dá)后發(fā)現(xiàn)它已嚴(yán)重受損。由于大部分內(nèi)存文件已損壞，埃洛伊永久刪除了黑底斯。接著，埃洛伊在設(shè)施內(nèi)找到缺少了從屬函式的蓋婭備份，于是她打算前往各地找回相關(guān)函式來(lái)把蓋婭恢復(fù)至完整形態(tài)，并成功定位“米諾娃”。突然，一群使用未來(lái)科技的入侵者進(jìn)入設(shè)施，隨行的索貝克克隆人取得另一個(gè)蓋婭備份，并發(fā)現(xiàn)埃洛伊。入侵者的首領(lǐng)指派同伴艾瑞克除掉埃洛伊，后者僥幸逃脫。

華爾把昏迷的埃洛伊帶到烏塔魯族的地盤，墓詠者佐沃引導(dǎo)埃洛伊至附近的煉鑄廠，而該處是米諾娃的藏身地。獲取米諾娃并使其與蓋婭合并后，后者成功啟動(dòng)，并為埃洛伊標(biāo)示“乙太”、“狄米特爾”、“波賽頓”的位置，但指另外三個(gè)函式“阿波羅”、“阿提米絲”、“以露西亞”失去蹤影。蓋婭建議埃洛伊先找到乙太、狄米特爾、波賽頓，然后再嘗試捕獲赫菲斯托斯，因?yàn)樗讷@得自由后發(fā)生了重大變化。蓋婭還揭示喚醒黑底斯的滅絕信號(hào)源于天狼星系，埃洛伊猜測(cè)當(dāng)時(shí)遠(yuǎn)峰殖民船奧德賽成功抵達(dá)目的地，但為了掩飾此事而假裝任務(wù)失敗，當(dāng)時(shí)帶著克隆人的入侵者則是遠(yuǎn)峰人的后裔。到達(dá)乙太的所在地后，埃洛伊與赫卡羅等人對(duì)抗叛軍，獲得赫卡羅的首肯后成功奪回它。

蓋婭隨后收到求救信號(hào)，埃洛伊等人前往調(diào)查，并在該處發(fā)現(xiàn)名為貝塔的索貝克克隆人。貝塔表示遠(yuǎn)峰人已經(jīng)奪得阿波羅、阿提米絲、以露西亞，但她設(shè)法竊取了他們的蓋婭備份并逃脫。她又推翻埃洛伊的猜測(cè)，指這群遠(yuǎn)峰人與千年前在“法羅機(jī)瘟”期間逃離地球的那批是同一群人，他們使用了各類科技來(lái)延長(zhǎng)其自然壽命。由于天狼星殖民地滅亡，遠(yuǎn)峰人重回地球?qū)ふ疑w婭以便抹除所有生命重新殖民，他們又在航行期間創(chuàng)造貝塔。

在拉斯維加斯的廢墟找回波賽頓后，埃洛伊接著前往加利福尼亞尋找狄米特爾。埃洛伊遇到來(lái)自太平洋彼岸的昆恩族，他們?cè)窖髞?lái)到此地希望找到有助解決家鄉(xiāng)生態(tài)危機(jī)的資料數(shù)據(jù)。埃洛伊與昆恩族的先導(dǎo)者艾娃同行，在尋找狄米特爾期間幫助她獲得相關(guān)數(shù)據(jù)。蓋婭隨后給出捕獲赫菲斯托斯的方法，但需要法羅的歐米加權(quán)限。埃洛伊前往舊金山廢墟，在昆恩族及其首領(lǐng)希伊歐的幫助下尋找法羅的地堡，希伊歐更自稱是法羅的化身。進(jìn)入地堡后，埃洛伊一行人發(fā)現(xiàn)法羅在過(guò)去千年間透過(guò)基因療法設(shè)法讓自己活下來(lái)，但同時(shí)突變并變得不似人型。驚恐萬(wàn)分的希伊歐下令燒毀法羅，但無(wú)意觸發(fā)失效安全裝置，摧毀了地堡。

埃洛伊和艾娃逃脫，希伊歐則被倒塌的法羅雕像壓斃。獲得歐米加權(quán)限后，埃洛伊一行人把蓋婭帶往雙子宮煉鑄廠以誘捕赫菲斯托斯。捕獲成功后，遠(yuǎn)峰首領(lǐng)杰拉德及其手下艾瑞克和媞爾達(dá)突入煉鑄廠，殺死華爾并帶走蓋婭和貝塔，但媞爾達(dá)卻幫助埃洛伊逃脫。媞爾達(dá)解釋自己曾經(jīng)是索貝克的朋友，被埃洛伊的所作所為啟發(fā)，希望幫助埃洛伊并阻止遠(yuǎn)峰。媞爾達(dá)又指賽倫斯支持叛軍以便利用他們來(lái)對(duì)抗遠(yuǎn)峰，她們則可借此分散遠(yuǎn)峰人的注意力來(lái)奪回蓋婭。埃洛伊拒絕犧牲提那科人，打敗了雷加拉（此時(shí)可選擇處決或說(shuō)服她加入），并強(qiáng)迫賽倫斯與她合作。

埃洛伊一行人突襲遠(yuǎn)峰基地，假如玩家此前說(shuō)服雷加拉加入，她則會(huì)在此時(shí)為保埃洛伊而犧牲自己。貝塔釋放赫菲斯托斯至遠(yuǎn)峰的電腦網(wǎng)絡(luò)內(nèi)，使它可以生產(chǎn)對(duì)抗遠(yuǎn)峰部隊(duì)的機(jī)器人。賽倫斯使用特殊設(shè)備使遠(yuǎn)峰人的防護(hù)罩失靈，埃洛伊和佐沃趁機(jī)殺死艾瑞克以祭華爾在天之靈。媞爾達(dá)殺死杰拉德，此時(shí)埃洛伊和貝塔亦發(fā)現(xiàn)遠(yuǎn)峰人的天狼星殖民地是被“涅墨西斯”摧毀，而非自然災(zāi)害。

媞爾達(dá)指涅墨西斯是失控的人工智能，是遠(yuǎn)峰人把意識(shí)數(shù)字化后的產(chǎn)物，雖然實(shí)驗(yàn)失敗但成果未被刪除，若干年后它突破封鎖并掌控殖民地的打印設(shè)施，把遠(yuǎn)峰人趕盡殺絕。涅墨西斯又向地球發(fā)送滅絕信號(hào)，現(xiàn)時(shí)更正在前往地球。遠(yuǎn)峰人實(shí)際上是在逃離涅墨西斯的追殺，并希望竊取蓋婭來(lái)殖民一個(gè)涅墨西斯無(wú)法觸及的新星球。媞爾達(dá)又承認(rèn)自己深愛(ài)伊麗莎白，后悔讓她死在地球上，因此試圖強(qiáng)迫埃洛伊登上奧德賽并一同逃離。埃洛伊拒絕放棄地球，并殺死了媞爾達(dá)。

賽倫斯透露黑底斯告訴他有關(guān)涅墨西斯的事，他一度打算偷走奧德賽和阿波羅逃離地球，但他現(xiàn)時(shí)改變主意，決定留下來(lái)幫助埃洛伊。事件告一段落后，埃洛伊的同伴前往各地傳播涅墨西斯正前往地球一事，埃洛伊和貝塔則重新啟動(dòng)蓋婭。